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1. 双线紫蛤COI基因序列多态性与水环境分析
王朋云
   2020, 42 (4): 324-338.  
摘要80)      PDF (4655KB)(281)    收藏
以双线紫蛤(Soletellina diphos)为研究对象,测定南日岛海区自然群体30枚个体的线粒体COI基因部分序列,研究其个体间的序列单核苷酸多态性(SNP),掌握双线紫蛤的遗传多样性;统计南日岛海域2008年4月—2018年12月期间海水样品的盐度、温度、pH、溶解氧、叶绿素a、透明度、化学需氧量、无机氮、无机磷、石油类10项理化因子检测结果,分析数据随季节月份变化状况,了解双线紫蛤栖息地水环境。结果显示,南日岛双线紫蛤群体30枚个体的序列中碱基T、C、A、G平均含量分别为41.95%、16.07%、18.53%、23.45%,(A+T)含量明显高于(G+C)含量,共发现13个核苷酸多态位点(转换/颠换偏倚率13.04),具有9个单倍型,有1个为引起亮氨酸/苯丙氨酸变化的非同义突变位点,单倍型多样性指数(Hd)为(0.598 0±0.103 0),核苷酸多样性(Pi)为(0.002 9±0.000 6),平均核苷酸变异数(k)为1.912 6,表现出略高于标准值的单倍型多样性和较低的核苷酸多样性,个体间的遗传距离为0~0.009 2、平均值为(0.002 9±0.001 0),Tajima’s D和Fu’s Fs中性检验的结果均为不显著负值,说明这个群体的双线紫蛤遗传相对稳定。南日岛产区水环境月均盐度变化范围为26.84~34.33、温度变化范围为13.27~29.33℃、pH变化范围为7.89~8.54、溶解氧变化范围为5.64 ~9.31 mg/L、叶绿素a变化范围为0.33 ~15.57 μg/L、透明度变化范围为0.40 ~1.79 m、化学需氧量变化范围为0.22 ~1.59 mg/L、无机氮变化范围为0.04 ~0.45 mg/L、无机磷变化范围为0~0.16 mg/L、石油类变化范围为0 ~0.20 mg/L,盐度、温度在各年春、夏、秋三季变化皆先升后降,夏季最高;pH、溶解氧则在春、夏两季波动呈下降;而无机氮在春、夏、秋季趋势为先降后升,夏季最低;除了化学需氧量和石油类以外,其余参数的周年变动均表现出一定的季节性差异规律,同时表明双线紫蛤在以上的理化条件下都可以进行生长繁殖。
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2. 双线紫蛤(Soletellina diphos)形态、序列测定和同工酶的初步研究
王朋云
渔业研究    2018, 40 (1): 1-15.  
摘要274)      PDF (6202KB)(913)    收藏
双线紫蛤(Soletellina diphos)是一种名贵的珍稀濒危经济贝类,在福建省莆田市分布于南日岛西南沿岸潮间带海域。为了解该群体的种质资源和遗传背景,从莆田市南日岛采集双线紫蛤样本,测量养殖1龄贝和野生2~3龄贝2个群体的壳长、壳高、壳宽和体重等性状并推导关系式;扩增野生个体的12S rRNA 、16S rRNA、COI、Cytb、H3、18S rRNA、ITS与28S rRNA序列并进行测序,结合紫云蛤科(Psammobiidae)或樱蛤总科(Tellinoidea)同源序列比对分析、计算遗传距离值、邻接法构建系统发育树;提取野生群体闭壳肌和斧足肌2种组织的EST、IDH、LDH、MDH、ME和SOD,比较组织特异性和多态性。结果表明,南日岛双线紫蛤样本的壳长与壳高、壳长与体重、壳高与体重之间相关性较高,群体间壳长与壳高比相近;同种内异地个体在12S rRNA 、16S rRNA、COI和Cytb序列碱基组成、遗传距离和邻接树上具有一定的遗传差异,16S rRNA、28S rRNA数据支持与亚当斯紫蛤(S. adamsii)为同种异名或地理亚种;除SOD外,EST、IDH、LDH、MDH和ME表达皆具有组织特异性,ME在闭壳肌中活性较强,EST酶谱清晰、带数显现多态性。本研究将为当地双线紫蛤自然资源后续的种质鉴定、遗传结构和多样性分析等研究提供有价值的参考依据。
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3. 莆田南日岛泥东风螺的形态、DNA条形码和同工酶初步分析
王朋云
   2017, 39 (4): 249-263.  
摘要361)      PDF (6600KB)(1852)    收藏
为了解莆田南日岛泥东风螺(Babylonia lutosa)种质情况,采集泥东风螺养殖群体对其样本的壳高(H)、壳宽(B)、体重(W)数量性状进行测量、推导关系式,以线粒体16S rRNA与COI、核18S rRNA与18S-28S rRNA基因为靶序列进行扩增和测序,结合同源序列与同属的其他7种东风螺或蛾螺总科(Buccinoidea)相关序列比对计算,以蝾螺属(Turbo)中华蝾螺(T. chinensis)作外群构建系统发育树,并提取样本个体的酯酶(EST)、苹果酸酶(ME)、超氧化物歧化酶(SOD)、乳酸脱氢酶(LDH)、苹果酸脱氢酶(MDH)和异柠檬酸脱氢酶(IDH)进行同工酶多态性分析。结果表明,南日岛泥东风螺(B. lutosa)个体之间壳面斑块不规则、螺壳形态差异不明显;系统发育树显示在东风螺属内泥东风螺和台湾东风螺(B. formosae)优先聚支、亲缘关系最近;个体间EST、SOD和IDH电泳观察到酶位点表达多态性,ME、LDH和MDH检测未发现酶带数多态性,仅存在酶活性表达差异。
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被引次数: Baidu(1)
4. 莆田后海养殖牡蛎的形态学观察和分子鉴定
王朋云
福建水产    2013, 35 (2): 100-105.  
摘要937)      PDF (3403KB)(1890)    收藏
对从莆田后海采集的人工养殖牡蛎群体样本进行数量性状分析,运用16S rRNA和CO I条形码技术进行分子鉴定,并进行IDH和SOD同工酶电泳分析。结果表明,后海的常见养殖牡蛎贝壳形状多变,品种为葡萄牙牡蛎而非僧帽牡蛎,不同个体的同工酶电泳结果显示为单态。
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